Владимир Мартынов

СИБР (хирургическое лечение и профилактика)


Скачать книгу

of bacteria within the human colonic microbiota / A. W. Walker, J. Ince, S. H. Duncan et al. // ISME. – J. – 2011. – № 5. – P. 220–230.

      107. Wu, G. D. Linking long-term dietary patterns with gut microbial enterotypes / G. D. Wu, J. Chen, C. Hoffmann et al. // Science. – 2011. № 334. – P. 105–108.

      108. Dethlefsen, L. Incomplete recovery and individualized responses of the human distal gut microbiota to repeated antibiotic perturbation / L. Dethlefsen, D. A. Relman // Proc. Natl. Acad. Sci USA. – 2011. – № 108 (Suppl. 1). – P. 4554–4561.

      109. Jernberg, C. Long-term ecological impacts of antibiotic administration on the human intestinal microbiota / C. Jernberg, S. Lofmark, C. Edlund et al. // ISME J. – 2007. – № 1. – P. 56–66.

      110. Hayashi, H. Molecular analysis of jejunal, ileal, caecal and recto-sigmoidal human colonic microbiota using 16S rRNA gene libraries and terminal restriction fragment length polymorphism \ H. Hayashi, R. Takahashi, T. Nishi et al. //.J Med. Microbiol. – 2005. – № 11. – P. 1093–10101.

      111. Wilson, M. Microbial Inhabitants of Humans: Their Ecology and Role in Health and Disease, 1st edn. New York: Cambridge University Press, 2005.

      112. Macfarlane, S. Regulation of short-chain fatty acid production / S. Macfarlane, G. T. Macfarlane // Proc. Nutr. Soc. – 2003. – № 62. – P. 67–72.

      113. Rajilic-Stojanovic, M. Diversity of the human gastrointestinal tract microbiota revisited / M. Rajilic-Stojanovic, H. Smidt, W. M. de Vos // Environ Microbiol. – 2007. – № 9. – P. 2125–3216.

      114. Dethlefsen, L. An ecological and evolutionary perspective on human – microbe mutualism and disease / L. Dethlefsen, M. McFallNgai, D. A. Relman // Nature. – 2007. – № 449. – P. 811–819.

      115. Lapierre, P. Estimating the size of the bacterial pan-genome / P. Lapierre, J. P. Gogarten // Trends Genet. – 2009. – № 25. – P. 107–110.

      116. Gill, N. The gut microbiota: challenging immunology / N. Gill, B. B. Finlay // Nat. Rev. Immunol. – 2011. – № 11. – P. 636–637.

      117. Norin, E. Intestinal microflora functions in laboratory mice claimed to harbor a «normal» intestinal microflora. Is the SPF concept running out of date? / E. Norin, T. Midtvedt // Anaerobe. – 2010. – № 16. – P. 311–320.

      118. Hooper, L. V. How host – microbial interactions shape the nutrient environment of the mammalian intestine / L. V. Hooper, T. Midtvedt, J. I. Gordon // Annu. Rev. Nutr. – 2002. – № 22. – P. 283–307.

      119. Turnbaugh, P. J. A core gut microbiome in obese and lean twins / P. J. Turnbaugh, M. Hamady, T. Yatsunenko et al. // Nature. – 2009. – № 457. – P. 480–484.

      120. Mortensen, P. B. Short-chain fatty acids in the human colon: relation to gastrointestinal health and disease / P. B. Mortensen, M. R. Clausen // Scand. J. Gastroenterol. Suppl. – 1996. – № 216. – P. 132–148.

      121. Tap, J. Towards the human intestinal microbiota phylogenetic core / J. Tap, S. Mondot, F. Levenez et al. // Environ Microbiol. – 2009. – № 11. – P. 2574–2584.

      122. Eckburg, P. B. Diversity of the human intestinal microbial flora / P. B. Eckburg, E. M. Bik, C. N. Bernstein et al. // Science. – 2005. – № 308. – P. 1635–1648.

      123. Zoetendal, E. G. Mucosa-associated bacteria in the human gastrointestinal tract are uniformly distributed along the colon and differ from the community recovered from feces / E. G. Zoetendal, A. von Wright, T. Vilpponen-Salmela et al. // Appl. Environ Microbiol. – 2002. – № 68. – P. 3401–3407.

      124. Macfarlane, S. Regulation of short-chain fatty acid production / S. Macfarlane, G. T. Macfarlane // Proc. Nutr. Soc. – 2003. – № 62. – P. 67–72.

      125. Johansson, M. E. Microbiology. Keeping bacteria at a distance / M. E. Johansson, G. C. Hansson // Science. – 2011. – № 334. – P. 182–183.

      126. Juge, N. Microbial adhesins to gastrointestinal mucus / N. Juge // Trends Microbiol. – 2012. – № 20. – P. 30–39.

      127. Johansson, M. E. The two mucus layers of colon are organized by the MUC2 mucin, whereas the outer layer is a legislator of host – microbial interactions / M. E. Johansson, J. M. Larsson, G. C. Hansson // Proc. Natl. Acad. Sci USA. – 2011. – № 108 (Suppl. 1). – P. 4659–4665.

      128. Macpherson, A. J. The immune geography of IgA induction and function / A. J. Macpherson, K. D. McCoy, F. E. Johansen // Mucosal Immunol. – 2008. – № 1. – P. 11–22.

      129. McGuckin, M. A. Mucin dynamics and enteric pathogens / M. A. Guckin, S. K. Linden, P. Sutton et al. // Nat. Rev. Microbiol. – 2011. – № 9. – P. 265–278.

      130. Salzman, N. H. Enteric defensins are essential regulators of intestinal microbial ecology / N. H. Salzman, K. Hung, D. Haribhai et al. // Nat. Immunol. – 2010. – № 11. – P. 76–83.

      131. Vaishnava, S. The antibacterial lectin RegIIIcpromotes the spatial segregation of microbiota and host in the intestine / S. Vaishnava, M. Yamamoto, K. M. Severson et al. // Science. – 2011. – № 334. – Р. 255–258.

      132. Macfarlane, G. T. The control and consequences of bacterial fermentation in the human colon / G. T. Macfarlane // J. Appl. Bacteriol. – 1991. – № 70. – P. 443–459.

      133. Leitch, E. C. Selective colonization of insoluble substrates by human faecal bacteria / E. C. Leitch, A. W. Walker, S. H. Duncan // Environ Microbiol. – 2007. – № 9. – P. 667–679.

      134. Walker, A. W. The species composition of the human intestinal microbiota differs between particle-associated and liquid phase communities / A. W. Walker, S. H. Duncan, H. J. Harmsen et al. // Environ Microbiol. – 2008. – № 10. – P. 3275–3283.

      135. Hopkins, M. J. Nondigestible oligosaccharides enhance bacterial colonization resistance against Clostridium difficile in vitro / M. J. Hopkins, G. T. Macfarlane // Appl. Environ Microbiol. – 2003. – № 69. – P. 1920–1927.

      136. Lievin, V. Bifidobacterium strains from resident infant human gastrointestinal microflora exert antimicrobial activity / V. Lievin, I. Peiffer, S. Hudault et al. // Gut. – 2000. – № 47. – P. 646–652.

      137. Servin AL. Antagonistic activities of lactobacilli and bifidobacteria against microbial pathogens / A. L. Servin // FEMS Microbiol. Rev. – 2004. – № 28. – P. 405–440.

      138. Flint, H. J. Interactions and competition within the microbial community of the human colon: links between diet and health / H. J. Flint, S. H. Duncan, K. P. Scott et al. // Environ Microbiol. – 2007. – № 9. – P. 1101–1111.

      139. Ley, R. E. Ecological and evolutionary forces shaping microbial diversity in the human intestine / R. E. Ley, D. A. Peterson, J. I. Gordon // Cell. – 2006. – № 124. – P. 837–8348.

      140. Freter, R. Mechanisms that control bacterial populations in continuous-flow culture models of mouse large intestinal flora / R. Freter, H. Brickner, M. Botney et al. // Infect. Immun. – 1983. – № 39. – P. 676–685.

      141. Wilson, K. H. Role of competition for nutrients in suppression ofClostridium difficileby the colonic microflora / K. H. Wilson, F. Perini // Infect. Immun1. – 988. – № 56. – P. 2610–2614.

      142. Juge, N. Microbial adhesins to gastrointestinal mucus / N. Juge // Trends Microbiol. – 2012. – № 20. – P. 30–39.

      143. Camilli, A. Bacterial small-molecule signaling pathways / A. Camilli, B. L. Bassler // Science. – 2006. – № 311. – P. 1113– 1116.

      144. Gantois, I. Butyrate specifically down-regulates salmonella pathogenicity island 1 gene expression / I. Gantois, R. Ducatelle, F. Pasmans et al. // Appl. Environ