arqueologia inevitavelmente provocou uma situação onde a profusão de descobertas arqueológicas — em vez de fundamentar as narrativas bíblicas —serviu para desacreditar a sua credibilidade, criando anomalias inexplicáveis. Os pesquisadores, por exemplo, tinham dificuldade em concordar que período arqueológico correspondia à idade patriarcal; concordar quando Abraão, Isaac e Jacob realmente viveram; e concordar acerca de quando foi o túmulo dos patriarcas em Hebron comprado para servir como um lugar do enterro para os patriarcas e matriarcas.
De acordo com a cronologia bíblica, Salomão construiu o Primeiro Templo alguns 480 anos após o êxodo do Egito (1 Reis 6:1) aos quais mais 430 anos têm de ser adicionados para a permanência no Egito (Êxodo 12:40) que, juntamente com a expectativa de vida extraordinária dos patriarcas originou no século XXI a data A.C. para a deslocação de Abraão para Canaã. Nenhuma evidência, no entanto, foi descoberta para corresponder com tal cronologia. Na década de 1960 Albright sugeriu que o percurso de Abraão devesse ser atribuído à Idade Média do Bronze (22-20 séculos A.C.), mas Benjamin Mazar — considerado como uma autoridade israelita no ramo da arqueologia bíblica — propôs que o fundo histórico da idade patriarcal deveria ser mil anos mais tarde, no século XI A.C. " período de povoamento." Tais propostas foram rejeitadas por outros que visualizaram a historicidade das narrativas como sendo lendas ancestrais narradas durante o tempo do Reino da Judeia.
Quanto ao êxodo do Egito, a caminhada no deserto e a narrativa do Monte Sinai, não havia nenhum documento egípcio para fundamentar tais alegações e enquanto alguns judeus podem ter sido expulsos do Egito antigo, é altamente improvável que o número de expulsos tivesse sido perto do número reivindicado pelos escribas judeus. Se tal acontecimento realmente tivesse ocorrido — 600.000 pessoas naqueles dias poderiam ter representado pelo menos um quarto da população do Egito — então certamente teria sido garantidamente e diligentemente registado ou mencionado pelo menos. Numerosos documentos egípcios, no entanto, mencionam o costume dos pastores nómadas de entrar no Egipto para o acampamento no Delta do Rio Nilo durante períodos de seca e a escassez de comida, mas tais incursões inofensivas ao longo de muitos séculos foram frequentes em vez de um solitário, excecional evento.
Além disso, os pesquisadores têm continuamente tentado localizar o Monte Sinai e os acampamentos no deserto das tribos nómadas, mas apesar dos esforços consideráveis, nem um único local foi localizado para coincidir com a narrativa bíblica. Porque os principais eventos da história dos israelitas não são justificados por descobertas arqueológicas, ou documentação não-bíblica, a maioria dos historiadores concorda que a estadia no Egito e os eventos do êxodo subsequente podem ter ocorrido para um número insignificante de famílias nómadas, cuja história foi embelezada para acomodar as necessidades de uma ideologia nacionalista.
Mesmo a narrativa historicamente importante de como a terra de Canaã foi conquistada pelos israelitas está sujeita a dúvida em consequência das dificuldades encontradas na tentativa de localizar a evidência arqueológica para apoiar essa contenção bíblica. As escavações por diferentes expedições em Jericó e Ai - cidades cuja conquista conscienciosamente é detalhada no Livro de Josué — produziram nada além da conclusão de que durante o acordado sobre o período para a conquista na parte final do século XIII A.C., não havia nenhuma cidade naquele local e certamente não havia paredes que poderiam "desmoronar-se.” Em resposta a esta falta de evidência, uma variedade de explicações fracas foi oferecida incluindo a sugestão de que as paredes de Jericó tinham sido destruídas pela chuva.
Há quase meio século atrás, eruditos bíblicos avançaram com a ideia de que as narrativas de conquista devem ser vistas como nada mais que lendas míticas, porque com a descoberta de mais e mais sítios tornou-se aparente que os locais em questão tinham em diferentes momentos simplesmente sido reduzidos ou abandonados. Portanto, em última análise, concluiu-se que não havia nenhuma evidência factual na existência para apoiar a narrativa bíblica de uma conquista por tribos israelitas numa campanha militar liderada por Josué.
Enquanto a narrativa bíblica exagera na medida — "grandes cidades com muros altíssimos" (Deuteronómio 9:1) — de fortificações da cidade de Cananeia conquistada pelos israelitas, a realidade era bem diferente com locais escavados onde se descobriu apenas restos de povoamento que consistiu num pequeno número de estruturas que dificilmente poderiam ser consideradas como cidades. Foi, por conseguinte, evidente que a cultura palestiniana urbana no final do século XIII A.C. se tinha desintegrado durante um período de centenas de anos, em vez de ser o resultado de uma conquista militar pelos israelitas.
Além disso, os autores das descrições bíblicas foram familiarizados com, ou deliberadamente ignoraram a realidade geopolítica na Palestina que estava sujeita ao governo egípcio até à metade do século XII A.C. Os centros administrativos egípcios localizavam-se em Gaza, Japho (Jaffa) e Beit She'an com provas de vários locais egípcios em ambos os lados do rio Jordão também sendo descobertos. A narrativa bíblica não menciona uma presença egípcia tão proeminente e é evidente que os escribas desconheciam, ou deliberadamente omitiram uma realidade histórica importante que as descobertas arqueológicas têm demonstrado um cenário bíblico de "grandes" cidades de Cananeia, fortificações inexpugnáveis com "muros altíssimos" e o heroísmo de alguns conquistadores israelitas assistida por Deus contra os mais numerosos cananeus, como sendo todas reconstruções teológicas desprovidas de base factual.
Mesmo o aparecimento gradual dos israelitas como povo foi objeto de dúvida e debate, porque não havia nenhuma evidência de uma conquista militar espetacular de cidades fortificadas, ou provas sobre a identidade real dos israelitas. Descobertas arqueológicas, no entanto, indicam que a partir de algum tempo depois de 1200 A.C., que é identificado com a fase de "povoamento", centenas de pequenos assentamentos estabeleceram-se na região central da colina onde os agricultores cultivavam as terras ou criavam ovelhas. Como já tinha sido estabelecido que esses colonos não tinham vindo do Egito, foi proposto — porque túmulos haviam sido descobertos na área de colinas sem assentamentos — que eles eram pastores rústicos que vagueavam por toda a região, mantendo uma economia de permuta com os habitantes do vale através do intercâmbio de carne por grãos. Com a desintegração gradual dos sistemas urbanos e agrícolas, no entanto, esses pastores de ovelhas nómadas foram forçados a produzir os seus próprios grãos, o que originou o estabelecimento de assentamentos pequenos mais permanentes.
"Israel" é mencionado num único documento egípcio datado de 1208 A.C., o período do rei Merneptah, que afirma que "saqueada é Canaã com todo o mal, Ascalon é tomada, Gezer é apreendida, Yenoam transformou-se como se nunca tivesse existido, Israel está desolada, a sua semente não." Referindo-se ao país pelo seu nome cananeu e mencionando várias das cidades do Reino, Merenptah tinha fornecido evidência de que o termo "Israel" foi dado a um dos grupos de população que residia na região de colina central de Canaã no final da Idade do Bronze, onde o Reino de Israel foi mais tarde estabelecido.
A arqueologia também desempenhou o seu papel ao trazer uma mudança na reconstrução da realidade de David e de Salomão, período de "monarquia unida" que a Bíblia descreve como sendo a altura dos poderes económico, militar e político dos antigos israelitas com as conquistas de David seguidas pelo governo do Salomão, tendo criado um império que se estendia da Gaza ao rio Eufrates: "porque ele controlava toda a região a oeste do Eufrates, de Tifsa até Gaza, todos os reis a oeste do Eufrates" (1 Reis 04:24). Descobertas arqueológicas em numerosos locais, no entanto, provam que os edifícios imponentes e magníficos monumentos atribuídos à época não eram nada mais do que estruturas funcionais, mas de resto comuns.
Das três cidades mencionadas nas maravilhosas e bem-sucedidas construções de Salomão, Gezer provou ser apenas uma cidadela, cobrindo uma área pequena e cercada por uma muralha de casamata barata que consistia de duas paredes mais finas, paralelas, com um espaço vazio entre elas; a cidade superior do Hazor foi apenas parcialmente fortificada — cerca de 7,5 hectares do total de 135 hectares — que tinha sido estabelecidos na Idade do Bronze; e Megiddo cobria uma pequena área com aquilo que deveria ter sido cabanas em vez de edifícios reais e sem indicação de ter tido um muro fortificado.
Mais contradições também surgiram como resultado de escavações em Jerusalém