уполномоченный Ленина по созыву Всероссийской партконференции. Став её делегатом и войдя в состав ЦК, Орджоникидзе вскоре вновь оказался в заключении. 14 апреля 1912 года он был арестован в Петербурге, приговорён к 3 годам каторги, которую отбыл в Шлиссельбургской крепости, а затем был выслан в Якутск, где работал врачом.
Вернуться из ссылки удалось лишь летом 1917 года, после чего «товарищ Серго» стал одним из главных организаторов революционного выступления в Петрограде.
Участвовал в вооруженном восстании в Петрограде. Находился среди руководства войск, направленных против А.Ф. Керенского и П.Н.Краснова. С декабря 1917 временный чрезвычайный комиссар района Украина. Организовывал помощь голодающим рабочим Донбасса и промышленного Центра (продовольствие с помощью продотрядов отбиралось у крестьян). С апр. 1918 временный чрезвычайный комиссар Юга России, член ЦИК Донской советской республики. Один из организаторов обороны Царицына (май 1918), где сблизился с И.В. Сталиным.
В годы Гражданской войны (1918‑1920) ‑ политический руководитель в войсках Красной армии. В 1918 году был членом Центрального исполнительного комитета Донской республики, одним из организаторов обороны Царицына (ныне Волгоград), председателем Совета обороны Северного Кавказа. В 1919 году ‑ член Революционного совета (РВС) 16‑й армии Западного фронта, затем ‑14‑й армии Южного фронта, один из руководителей разгрома войск Деникина под Орлом, освобождения Донбасса, Харькова, Левобережной Украины.
6 июля выступил с докладом об объединении всех областей Северного Кавказа в единую республику: «Советы будут звеньями, которые должны спаять между собой свободных рабочих, крестьян, казаков и горцев. Интересы всего народа диктуют Сев. Кавказу сплотиться и протянуть руку пролетариату остальной России»: на съезде была образована Северокавказская советская республика. После окончания работы съезда Орджоникидзе выехал на Терек, где вспыхнул антисоветский казачий мятеж.
В годы Гражданской войны за Орджоникидзе закрепилось прозвище «таран революции»: его направляли в самые «горячие точки» для решения оперативных вопросов, и практически всегда «товарищ Серго» с поставленными задачами справлялся.
В начале 1920-х Орджоникидзе стал главным куратором установления советской власти в Закавказье. Благодаря его воле и энергетике эту задачу успешно удалось решить в сжатые сроки.
В 1922 году Грузия, Армения и Азербайджан объединились в Закавказскую Социалистическую Федеративную Советскую Республику (ЗСФСР), которая стала одним из субъектов Договора об образовании Советского Союза.
Орджоникидзе стал первым руководителем ЗСФСР, возглавляя её с 1922 по 1926 годы.
В этот же период он заслужил ещё одно прозвище: «сталинский ишак». Таким «эпитетом» наградил товарища Серго один из лидеров грузинских коммунистов Кабахидзе, недовольный тем, что Орджоникидзе поддерживал сталинский план автономизации. Идея плана заключалась в том, что новое единое государство должно было быть образовано за счёт вхождения всех республик в состав РСФСР. «Товарищ Серго» на обвинения