между ними так и не состоялось, поскольку в их борьбу вмешался прибывший в Александрию римский полководец Гай Юлий Цезарь. Решив разобраться в династическом споре, он тайно вызвал Клеопатру из изгнания. Однако проникнуть в столицу, охраняемую людьми Птолемея, было очень трудно. Тогда царевна пошла на хитрость: взяв с собой лишь одного из друзей, Аполлодора Сицилийского, она села в рыбачью лодку и при наступлении темноты пристала вблизи царского дворца. Она забралась в мешок для постели, а Аполлодор, обвязав мешок ремнем, пронес ее в покои Цезаря. Здесь молодая царица бросилась к ногам римского диктатора и стала жаловаться на своих притеснителей. У молодой царицы был чудесный голос, а благодаря своему обаянию она умела разговаривать со всяким. В итоге Цезарь был пленен ее красотой и встал на сторону Клеопатры.
Однако это решение вызвало недовольство египтян, которое переросло в восстание против римлян. Последние были вынуждены сидеть в осаде до подхода подкреплений во главе с Митридатом Пергамским. Повстанцы были разбиты, а царь Птолемей XIII утонул, пытаясь бежать из Египта. Одержав победу в войне, Цезарь возвратил Клеопатре египетский трон, а в соправители дал ей младшего брата – Птолемея XIV. В благодарность Клеопатра устроила Цезарю великолепное путешествие вверх по Нилу. Цезарь, очарованный египетской царицей, забросил все государственные и военные дела и готов был проплыть с ней через весь Египет. Однако сложное положение в Риме и его провинциях заставило Цезаря вернуться к суровой действительности.
После смерти старшего брата, Птолемея XIII, его провозгласили новым фараоном совместно с Клеопатрой VII. Между Птолемеем XIV и Клеопатрой был заключен символический брак в традициях правящей династии Птолемеев, по которым на престоле Египта обязательно восседать быть мужской представитель династии.
Юлий Цезарь отправился на войну, а Клеопатра осталась на родине, где вскоре родила сына, названного Цезарем Птолемеем. В историю он вошел под именем Цезарион. Спустя год Цезарь пригласил Клеопатру вместе с сыном в Рим. Прибывшая в Рим царица Египта повергла всех в шок своей ослепительной красотой. Облаченная в платье, украшенное драгоценными камнями, она сидела на троне, сделанном из чистого золота. Ее голову венчала золотая змея. Сопровождал Клеопатру кортеж золотых колесниц, а тысячи рабов вели целые стада ручных газелей и гепардов. Довольный Цезарь поселил гостью в огромной вилле на берегу Тибра, где она принимала знатных римлян, спешивших засвидетельствовать свое почтение фаворитке.
Между тем ненависть римлян к Клеопатре нарастала. Ходил даже слух, что она так привязала к себе Цезаря, что тот решил стать фараоном и перенести столицу Римской империи в Александрию. В итоге 15 марта 44 г. до н. э. Юлий Цезарь был убит близкими соратниками во время заседания Сената.
Из оглашенного во время похорон завещания стало известно, что Цезарь назначил своим преемником племянника Октавиана, а о сыне Птолемее Цезарионе в завещании не было ни слова.