Мстя афонцам за сочувствие повстанцам, они на девять лет разместили на святогорском клочке земли свое трехтысячное войско. На монастыри легло тяжелое бремя содержать оккупантов, они обязаны были также поставлять рабочую силу на нужды регулярной армии. Это привело к тому, что к 1830 году из шести тысяч монахов на Афоне осталось менее тысячи. Ситуацию усугубляло временное правительство Греции, несамостоятельное и не уверенное в своих силах. Были конфискованы все афонские земли в пользу греческого государства, якобы для помощи по выходу из кризиса.
Освобождению греков помогли европейские государства. Над Грецией установили протекторат, ее признали суверенной страной. Но поставленный король лишь ухудшил ситуацию для Церкви. Власть константинопольского патриарха отменялась, церковные вопросы переходили в ведение гражданских властей, более 600 монастырей, в том числе и мелкие афонские, были закрыты. Для монастырской жизни начался упадок.
Греки, воодушевленные борьбой, в освободительном запале в 1922 году начали авантюрное вторжение в Турцию с целью отвоевания когда-то захваченных земель. Это закончилось трагедией с массовыми жертвами и волнами миграций. Было вырезано 150 тысяч мужчин, женщин и детей в турецком городе Смирна, где проживало греческое население; сам же город был сожжен. После дипломатического соглашения приняли решение о массовом обмене населением: 400 тысяч мусульман депортировали из Греции в Турцию, а более миллиона православных греков перемещались в обратном направлении. Монастыри по мере своих возможностей помогали в сложившейся ситуации, спасали беженцев, давали приют обездоленным. Этот обмен населением вошел в историю под названием Малоазиатской катастрофы; греческое присутствие в Малой Азии, продолжавшееся в течение двух тысячелетий, сводилось на нет. Оставалась лишь небольшая православная община в Константинополе и на двух островах в устьях Дарданелл.
Здесь правил целое тысячелетье
Суровый православный крест,
И потому особо многоцветье
Ценю я этих райских мест.
Но пало царство Византии
И Третий Рим не воссиял,
Москве не удалось Россию
Ввести на римский пьедестал.
…Борьба веков свелась в итоге
Лишь к пляжным играм и ветрам,
И легионы больше по дорогам
Не маршируют стройно тут и там…
Дальнейшие события ХХ века сопровождались не менее трагичными потрясениями, волны которых доходили до афонского уединения. Итальянская и немецкая оккупации в ходе Второй мировой войны завершаются гражданской войной. Чтоб навести порядок, во внутренние дела Греции вмешиваются европейские государства; но все это не приводит к стабилизации обстановки, а заканчивается голодом и инфляцией. Монашеская жизнь представляется единственным оазисом спокойствия и умиротворения. В 1981 году Греческое государство вступило в Европейское экономическое сообщество. Монашеской