защитники вновь разделились. Клингоф и Геллерт переправились на противоположный берег Лены и укрылись в Мегинском улусе вблизи от города, В.Н. Соловьев и прапорщик Панкратьев остались на месте, а Бондалетов с группой милиционеров отправился далее по Вилюйскому тракту, где на следующий день был арестован красногвардейцами и отправлен в Якутск. 7 июля, посланный вдогонку за отступившими защитниками Якутска мархинский летучий отряд277 обходными путями достиг базы земской милиции на реке Кемэкэмэ и без сопротивления захватил находившихся на ней лиц. Часть из них бежала в тайгу, а остальные, включая Бондалетова и Клингофа, попали в плен. На складе были захвачены продукты278, но пушнины и мамонтовой кости там не оказалось. Бондалетов показал, что члены Областного совета отправились на юг. Вслед за ними были посланы восемь красноармейцев, а остальные вернулись в Якутск.
1 июля 1918 года исполком Совета рабочих депутатов Якутска вместе с командованием красного отряда собрался на своё первое совещание, в качестве областной власти. В целях повышения своего авторитета и расширения базы он пополнился представителями красноармейцев и крестьян и был переименован в Совет рабочих, крестьянских, красноармейских депутатов. На его первом заседании были приняты решения об организации временного боевого отряда для охранной службы, о введении в Якутске и области военного положения, о создании следственной комиссии, после чего начались аресты членов Областного совета и его активных сторонников, а 11 июля были упразднены областная и уездные земские управы. Через восемь дней был ликвидирован окружной суд и духовная консистория. Вслед за этим последовали череда увольнений реакционеров из администрации, суда и прокуратуры, а также военных органов и милиции.
На следующий день обновлённый Совет образовал военную коллегию279 и наложил контрибуции на 72 представителей буржуазного класса города Якутска и 25 жителей селений Марха, Павловск и Маган280. Она составляла полтора миллиона рублей и должна была быть уплачена до 16 июля. В случае неуплаты конфисковалось имущество и передавалось в революционный суд. Наряду с контрибуцией несколько позже281 был введён подоходный прогрессивный налог на домовладельцев Якутска282, предназначенный для содержания рабоче-крестьянской милиции. Кроме того, для вооружения Красной Гвардии конфисковалось любое огнестрельное оружие, включая дробовики283. Начальником советской милиции был назначен Х.А. Гладунов, который во время взятия города лично застрелил мирового судью и следователя Ф.Н. Банковского и ограбил его дом.
9 июля уполномоченный Центросибири П.А. Ойунский обратился к трудящимся Якутской области с призывом активно участвовать в организации советской власти на местах. Как и повсюду в России советская власть в Якутске опиралась на использование того энтузиазма, который возник у маргинальных слоев населения империи февральской революцией и Октябрьским переворотом