подводная лодка была вынуждена погрузиться. Вечером 13 сентября у острова Утё подводная лодка выпустила две торпеды по немецкому конвою, но в цель не попала. Днем 14 сентября «Лембит» обнаружила конвой противника, и двумя торпедами потопила транспорт «Финланд».
В ночь на 15 сентября 1942 года подводная лодка отошла к мысу Ристна и через сутки начала форсирование Финского залива. С наступлением темноты вечером 17 сентября на
Западном Гогландском плесе подводная лодка всплыла для зарядки батареи, но зарядку пришлось прекратить, так как подводную лодку обстрелял из автоматической пушки сторожевой катер противника. 18 сентября на «Лембит» сбросили глубинные бомбы финские сторожевые катера VMV-2 и VMV-13. Днем «Лембит» прибыла на Лавенсари, а утром 22 сентября в Кронштадт. 5 октября 1942 года «Лембит» перешла в Ленинград для ремонта и зимней стоянки. В августе – ноябре 1943 года «Лембит» прошла ДОКование и средний ремонт.
С наступлением весны 1944 года подводная лодка перешла в Кронштадт. В сентябре 1944 года Финляндия вышла из войны, корабли Балтийского флота имели возможность финскими шхерными фарватерами выходить в открытую часть Балтики, финны предоставили советской стороне свои порты и ремонтную базу. 5 октября 1944 года «Лембит» завершила переход в Балтийское море. При первом же погружении обнаружилась необходимость в дифферентовке и подводной лодке пришлось вернуться к Утё. Вечером 7 октября подводная лодка продолжила поход и в ночь на 11 октября произвела минную постановку. Вечером 12 октября 1944 года «Лембит» обнаружила легкий крейсер «Нюрнберг», но атака не состоялась из-за большой скорости и частого изменения курса цели. Ночью 13 октября в 45 милях южнее острова Эланд «Лембит» двумя торпедами атаковала одиночное судно. Транспорт сумел уклониться, и подводной лодке пришлось потратить еще две торпеды для поражения цели.
В ночь на 16 октября 1944 года в виду израсходования запасов топлива «Лембит» начала возвращение на базу и к вечеру 18 октября прибыла в Хельсинки. Так как соглашение о ремонте советских кораблей в Финляндии не было до конца урегулировано, подводной лодке для ремонта пришлось идти в Кронштадт, где она с 30 октября по 14 ноября прошла ДОКование. 27 ноября подводная лодка прибыла на Ханко. 3 декабря подводная лодка произвела минную постановку в 3-х милях северо-западнее маяка Брюстерорт.
Утром 11 декабря 1944 года «Лембит» произвела торпедную атаку по конвою. Через 35 секунд после пуска торпед на подводной лодке был услышан взрыв большой силы – на подводной лодке были повреждены легкий корпус и ограждение рубки, а вскоре обнаружилось сильное поступление воды в прочный корпус. Вечером того же дня подводная лодка начала возвращение на базу. Днем 14 декабря западнее острова следуя в подводном положении «Лембит» ударилась о подводный предмет. Подводную лодку подбросило на четыре метра, затем она сползла с неизвестного объекта. Немедленно всплыв, подводная лодка обнаружила на поверхности воды пятно соляра и деревянный решетчатый люк и его обломки. У самой