«Нерпа» ушла в Николаев, в нем была разоружена и поставлена в завод для проведения капитального ремонта, который затянулся на шесть лет.
Последний Боевой выход в море совершила подводная лодка «Тюлень» с 20 по 24 сентября 1917 года. Подводная лодка потопила у входа в Босфор парусник, а в ночь на 23 сентября 1917 года захватила пароход «Kozlu» и привела его в Севастополь в сопровождении двух вызванных для этого эсминцев.
Из числа строившихся для Черного моря новых подводных лодок тип «Лебедь», в Боевых действиях успела принять участие только подводная лодка «Гагара», вступившая в строй 20 июня 1917 года. «Гагара» дважды ходила к Босфору, потопила шесть парусников и вынудила выброситься на берег пароход «Vatan».
3 декабря 1917 года в силу подписанного между русским и германо-турецким морским командованием перемирия Боевые действия на Черном море прекратились.
В результате октябрьского переворота 1917 года в Петрограде Черноморский флот разделился на белых и красных, и перемешался, невзирая на приказы командования и проведение митингов. В конце концов, моряки Русского флота завладели остатками кораблей флота и всем, что полагалось для их эксплуатации, а красные, потопив у Новороссийска то, что досталось им, сошли на берег и, пополнив ряды пехотинцев, воевали на суше. На море наступило затишье.
В начале 1918 года вступила в строй подводная лодка «Буревестник». 14 января 1918 года подводная лодка «Нерпа» вошла в состав красных Морских Сил. В этом же году была введена в строй подводная лодка АГ-21 и в Николаеве спущена на воду подводная лодка АГ-22.
С 1 февраля в красной России перешли на григорианский календарь, вместо действовавшего ранее юлианского. После 31 января 1918 года последовало не 1 февраля, а сразу 14 февраля 1918 года. Однако на кораблях Русского флота счет дней вели по старому стилю, в лучшем случае записывая двойную дату через дробь. В марте 1918 года на подводной лодке «Нарвал» по неизвестной причине функционировал судовой комитет, хотя на Балтике Центробалт и судовые комитеты были распущены еще в феврале как органы, дезорганизующие управление и разлагающие судовые команды. На Черном море комитеты продолжали разваливать флот. 3 марта был заключен Брестский мир. Территория Украины отторгалась от России. Взяв Перекоп, германские войска двинулись к Севастополю, чтобы захватить корабли Черноморского Флота. Красные части с трудом сдерживали германские войска. Германское военное командование, маскируя свои истинные намерения, потребовало передать Черноморский флот «украинской державе». Немцы обещали не трогать корабли флота, если они поднимут украинские флаги и подчинятся украинскому командованию гетмана Скоропадского. 12 марта подводная лодка №-3 была оставлена на реке Дунай в районе г. Рени и захвачена австро-венгерскими войсками. В силу технической недозрелости противника, или, скорее всего, за ненадобностью, подводная лодка не была приведена в боевое состояние. Позже она досталась румынским войскам и исчезла. 17 марта подводная лодка