обители была постройка каменного храма. При освящении храма блаженный Варлаам почтен был саном игумена. Этого звания по смирению своему святой Варлаам не искал, потому что свое дело он ставил выше всяких названий и чинов. Он знал, что на деле, в жизни он владеет душами своей братии, поручительством чему являются любовь братии к их наставнику и беспрекословное подчинение не за страх, а за совесть.
Перед кончиной преподобного к нему из Константинополя прибыл Антоний, с которым он был в дружеских отношениях. Приезд Антония обрадовал святого Варлаама, потому что, чувствуя приближение своей кончины, он затруднялся в выборе себе преемника. Он благодарил Господа Бога за мудрое устроение дела, увидев в Антонии преемника себе, указанного Господом. Поэтому он передал Антонию обитель, сказал следующие слова: «Возлюбленный брат мой! Божие благоволение почивает над сею обителью. Ныне я передаю в твои руки сию обитель. Блюди ее и заботься о ней. Я уже отхожу к Царю Небесному. Но не смущайся сим: телом я покидаю, духом же всегда буду с вами». Преподав наставление братии, завещав ей соблюдать православную веру и всегда пребывать в смирении, преподобный Варлаам предал дух свой Господу 6 ноября 1192 года.
Блаженный архиепископ Евфимий, живший в XV веке, собственными очами видел нетленные мощи святого Варлаама Хутынского. По древнему житию, дело представляется так. Святитель, призвав Хутынского игумена Тарасия, заповедал братии монастыря три дня поститься и совершать келейно молитвы, чтобы узнать волю Божию о святом основателе обители. По истечении трех дней архиепископ Евфимий, игумен Тарасий и иподиакон Иаков вошли в храм. Подошли с благоговением к гробнице преподобного, подняли каменную крышку – и увидели нетленное тело. Святители при этом прославили Господа, а иподиакон Иаков, при виде такого чудесного явления, решил принять иноческий чин. После этого мощи святого Варлаама оставались скрытыми от взоров людских.
Московский великий князь Иоанн III, разгневавшись на Новгород опустошил Новгородскую область. Гордым и грозным победителем он вошел в Новгород. Отправился и в Хутынскую пустынь, якобы помолиться преподобному. Увидев, что гробница святого Варлаама закрыта, он спросил, почему это делается. Игумен отвечал князю: «С давних времен никто не смеет видеть святые мощи преподобного основателя обители, – ни для князей, ни для бояр, ни для архиепископов не открывают их, пока Господь не соблаговолит явить их миру». В гордом упоении своей великокняжеской властью, которой должно, думал князь, все повиноваться, он грозно приказал открыть мощи. Но тут же на месте был посрамлен. Едва дотронулись, по приказанию князя, до крышки гробницы, как из нее вырвались сначала клубы густого дыма, а затем огонь, начавший наполнять храм. Великий князь в ужасе бежал вон со всею своею свитою, оставив даже трость свою в церкви. Историческими свидетелями сего грозного события остались в монастыре упомянутая трость испуганного проявлением гнева и силы Господней князя и обожженная пламенем дверь