Крымского фронта, который понес большие потери в конце 1941-го и начале 1942 года, Ивашутин доложил своему непосредственному руководству, что виной керченской трагедии были паникерское поведение уполномоченного Ставки ВГК Маршала Советского Союза Г. И. Кулика и волюнтаризм заместителя наркома обороны армейского комиссара 1-го ранга Л. З. Мехлиса, которые упорно убеждали И. В. Сталина, что все поставленные задачи они выполняли правильно. Но результат оказался трагичен – жертв было море. Когда Мехлис явился с докладом к Сталину, тот, не пожелав слушать его, сказал только одну фразу: «Будьте вы прокляты!» и вышел из кабинета.
В 1942 году П. И. Ивашутин назначается начальником Особого отдела НКВД Юго-Западного фронта (ЮЗФ) второго формирования (25.10.1942 – 20.10.1943), который участвовал в операциях «Уран» – контрнаступление под Сталинградом, Среднедонской, Острогожско-Россошанской, третьей битве за Харьков, Изюм-Барвенковской наступательной операции, Донбасской стратегической операции, Запорожской. Военный контрразведчик пользовался уважением у командующих фронтом генералов армии Н. Ф. Ватутина и Р. Я. Малиновского.
20 октября 1943 года ЮЗФ на основании приказа Ставки ВГК от 16 октября того же года был переименован в 3-й Украинский фронт (УФ), который участвовал в битве за Днепр, освобождении Днепропетровска и Днепродзержинска, в осуществлении Никопольско-Криворожской, Одесской, Ясско-Кишиневской, Белградской, Будапештской и Балатонской операций и освобождении Румынии и части Австрии со столицей Веной. С 15 мая 1944 по 15 июня 1945 года 3-м Украинским фронтом командовал Маршал Советского Союза Ф. И. Толбухин.
После Ясско-Кишиневской операции встал вопрос о разгроме одного из сателлитов Германии – Румынии. УКР фронта во главе с П. И. Ивашутиным и вместе с военными разведчиками разработали операцию по выведению Румынии из войны мирным путем. Интенсивно шли переговоры с румынским королем Михаем Первым.
В это время в штаб фронта прибыл Г. К. Жуков, который приказал Ф. И. Толбухину срочно подготовить и провести операцию по разгрому румынской армии. В кабинете присутствовал Ивашутин. Он корректно стал объяснять представителю Ставки, что готовится срочная операция по выведению Румынии из войны.
– Какая еще срочная операция?! Я приказываю штурмовать позиции врага, – напрягся Жуков. Исполнительный Толбухин понимающе молчал.
– Товарищ маршал, – проговорил генерал-майор Ивашутин, – война заканчивается. В случае наступления мы положим тысячи наших солдат, так нужных стране после войны, когда все можно сделать мирно.
– Товарищ Толбухин, вы получили приказ?
– Да, Георгий Константинович…
– Тогда выполняйте!
– Есть!
Жуков прекратил разговор, хлопнув дверью, и умчался в машине на полевой аэродром.
– Федор Иванович, я понимаю принцип единоначалия и сущность военных приказов, тем более продолжается война, но то, что произошло сейчас, заставляет меня действовать. Я вынужден о приказе Жукова доложить своему руководству.
– Ваше