система в России: история, современное состояние, перспективы» (совместно с А. В. Иванченко и А. В. Кыневым, 2005 год) и «Российские выборы от перестройки до суверенной демократии» (совместно с А. В. Иванченко, 2006 год, 2-е, исправленное и дополненное издание – 2007 год) – обе книги относятся к наиболее цитируемым российским публикациям в области выборов; проведена международная конференция «Российские выборы в контексте международных избирательных стандартов» и издан сборник ее материалов (в нее вошел и подготовленный к конференции при моем участии подробный доклад); подготовлены и изданы коллективные монографии «Гражданам об их политических правах» и «Обеспечение открытости органов власти для граждан и юридических лиц»; подготовлены и изданы пять выпусков бюллетеня «Мониторинг демократических процедур», описывавших 25 избирательных кампаний по выборам региональных парламентов 2006—2007 годов, выборы в Государственную Думу 2007 года, а также прошедший в 2007 году процесс ликвидации более половины политических партий.
Параллельно по заказу ЦПК «Никколо М» я участвовал в написании книг «Мертвые души. Методы фальсификации итогов голосования и борьба с ними» (совместно с А. Ю. Бузиным и А. В. Кыневым, 2007 год) и «Преступление без наказания: Административные технологии федеральных выборов 2007—2008 годов» (совместно с А. Ю. Бузиным, 2008 год).
В 2007 году А. В. Иванченко пошел работать руководителем РЦОИТ при ЦИК России, и к середине 2008 года финансирование НИВ иссякло. Мне нужно было искать другое место работы. В это время руководитель Ассоциации «ГОЛОС» Л. В. Шибанова, с которой я уже длительное время сотрудничал, предложила начать работу над проектом Избирательного кодекса РФ. Поскольку я морально к этой работе уже был готов, я охотно согласился и возглавил общественный проект по созданию Избирательного кодекса. В ходе этой работы мы провели более 20 круглых столов в Москве и регионах и в начале 2011 года подготовили и издали в виде книги не только проект Избирательного кодекса, но и подробные комментарии к нему. Год спустя наш проект был официально внесен в Государственную Думу группой депутатов от «Справедливой России», но был им возвращен по формальным основаниям.
Параллельно я в 2008—2010 годах участвовал в руководимом Г. В. Голосовым проекте «Межрегиональная электоральная сеть поддержки», где занимался в основном просвещением в области выборов, а в 2009—2010 годах под эгидой «Либеральной миссии» совместно с А. В. Кыневым написал книгу «Партии и выборы в современной России: Эволюция и деволюция» (вышла в 2011 году), которая стала одной из наиболее цитируемых российских публикаций в области выборов.
В 2011—2012 годах в рамках Ассоциации «ГОЛОС» занимался мониторингом региональных и федеральных выборов и изданием докладов по итогам мониторинга, а также подготовкой и обсуждением предложений по реформированию системы муниципальных выборов.
В 2012 году А. Л. Кудриным были созданы Комитет гражданских инициатив и Фонд