дивизии им. СНК УССР (1922), повторные курсы среднего комсостава при 2-м кавалерийском корпусе им. СНК УССР (1924), Украинскую кавалерийскую школу им. С. М. Будённого в г. Первомайск (1927), Военную академию РККА им. М. В. Фрунзе (1938), двухмесячные курсы при Академии Генштаба Кр. армии им. К. Е. Ворошилова (1941). В Гражданскую войну М. П. Кононенко 6 марта 1918 г. добровольно вступил в красногвардейский отряд Василия Дидова и воевал с ним против германских войск в Херсонской губ. С апреля 1919 г. служил в 5-м Заднепровском и 2-м ударном стрелковых полках, а с января 1920 г. командовал отделением во 2-м кавалерийском полку бригады Г. И. Котовского 45-й Волынской стрелковой дивизии. В составе этих частей воевал против войск генералов П. Н. Краснова и А. И. Деникина на Южном фронте, весной и летом 1920 г. участвовал в боях с белополяками на Юго-Западном фронте. Осенью и зимой 1920-1921 гг. сражался с петлюровцами, бандами Грызко, Хмары, Махно, Ворончика, Маруси, Тютюнника и других на Украине, весной и летом 1921 г. участвовал в подавлении антисоветского восстания А. С. Антонова в Тамбовской губ. За отличия в боях был награжден орденом Красного Знамени (май 1922 г.). В послевоенный период с февраля по ноябрь 1922 г. М. П. Кононенко учился в дивизионной кавалерийской школе 9-й Крымской кавалерийской дивизии им. СНК УССР, затем служил пом. командира и командиром взвода в 18-м кавалерийском полку 4-й кавалерийской дивизии УВО (с января 1923 г. – 3-й Бессарабской). С декабря 1923 по апрель 1924 г. учился на повторных курсах среднего комсостава при 2-м кавалерийском корпусе им. СНК УССР, затем вернулся на прежнюю должность (в сентябре 1924 г. 18-й кавалерийский полк был переименован в 15-й). С августа 1925 г. проходил обучение в Крымской кавалерийской школе в Симферополе, а с октября 1926 г. – в Украинской кавалерийской школе им. С. М. Будённого в г. Первомайск. После окончания последней вернулся в 3-ю Бессарабскую кавалерийскую дивизию им. Г. И. Котовского и служил в 13-м кавалерийском полку командиром взвода и врид начальника полковой школы, командиром эскадрона и начальником хозяйственного довольствия полка, вновь начальником полковой школы. С мая 1935 по август 1938 г. учился в Военной академии РККА им. М. В. Фрунзе, затем был назначен начальником 1-й (оперативной) части штаба 16-й кавалерийской дивизии КОВО. 2.9.1940 назначен командиром 91-го горнокавалерийского полка ЗакВО, а в марте 1941 г. переведен в ОрВО на должность командира 48-го мотострелкового полка. В начале Великой Отечественной войны подполковник М. П. Кононенко в сентябре 1941 г. был командирован на учебу в Академию Генштаба Кр. армии им. К. Е. Ворошилова, после прохождения двухмесячных курсов в ноябре назначен командиром 36-й отдельной курсантской стрелковой бригады САВО. В декабре убыл с ней на Западный фронт и в составе 16-й армии участвовал в боях на истринском направлении. Указом ПВС СССР от 12.4.1942 М. П. Кононенко был награжден орденом Красного Знамени. Однако в том же месяце за невыполнение бригадой боевой задачи и большие потери он был арестован и находился под следствием органов НКВД. Приговором Военного трибунала Западного фронта от 12.5.1942 осужден по ст. 193-17 п. «б» УК РСФСР к высшей мере наказания – расстрелу, замененному затем 10 годами лишения свободы с отсрочкой исполнения
