Совета Народных Комиссаров СРР Абхазия, а в апреле 1930 года по личной инициативе И.В.Сталина НА Лакоба занял пост Председателя Центрального Исполнительного Комитета ССР Абхазии. Лакоба был человеком с многочисленными серьезными хроническими заболеваниями; так, он страдал тяжелой формой стенокардии, обостренной гипертонией с постоянными приступами тахикардии, однако все недуги тщательно скрывал от ближайшего окружения и от Сталина. Имея вторую степень тугоухости, НА Лакоба с 1926 года постоянно носил слуховой аппарат Phonophor фирмы Siemens. За глаза Лакобу в Абхазии звали «Адагуа»– Глухой. Примечательно, что Нестор Лакоба имел двойника – Давлета Чантовича Кандалиа (он работал водителем и сотрудником охраны одновременно с 25 августа 1933 года), которого подобрал лично в целях безопасности, поэтому разговоры о том, что Председатель ЦИК Абхазии никого и ничего не боялся, являются чистейшей выдумкой.
Лакобу в сталинском Политбюро считали тенденциозным политиком, бескомпромиссным, яростно отстаивающим на любых уровнях явно утопическую идею автономности Абхазии и ее особого политэкономического статуса в СССР, а также проведения «умеренной» коллективизации, в соответствии с укладом жизни местного населения. Уровень его идей по предоставлению Абхазии максимум экономических, территориальных и политических преференций по современным меркам можно считать явным сепаратизмом. Н.А. Лакоба в течение многих лет убеждал Сталина (абхазский лидер в течение 7 лет приезжал по приглашению в дома отдыха ЦИК «Зензиновка» и «Пузановка», где отдыхал Сталин) присоединить Абхазскую ССР к Краснодарскому краю (тогда Азово-Черноморский край), причем оставив ей статус автономности, по аналогии с Адыгеей. К 1936 году его постоянные идейные разногласия с верхушкой Политбюро и лично Сталиным достигли апогея. Лакоба хотел, чтобы Абхазия жила по его неписаным законам, а не законам, принятым в СССР с личного одобрения и согласия И.В.Сталина.
27 декабря 1936 г. НА Лакоба, будучи вызван в Тбилиси, после пребывания дома у И. Сухишвили и Н. Рамишвили (основатели Ансамбля народного танца Грузии), отправился на ужин по приглашению матери Берии – Марты Виссарионовны в семью Первого секретаря ВКП(б) Грузии Л.П. Берии, после чего последний предложил пойти вместе в театр на премьеру балета «Мзечабуки». Через три часа после ужина у Лакобы, прямо в театре, начались симптомы, похожие на острый приступ стенокардии. Ранним утром 28 декабря 1936 года в 4 ч.20 мин. Лакоба умер, не приходя в сознание. Скорее всего, утверждения о том, что Лакобу отравили цианидами по личному распоряжению И.В. Сталина и при участии Л.П. Берии, являются нелепостью (смерть Лакобы, возможно, связана с неоказанием ему квалифицированной медицинской помощи при приступе стенокардии). Лакобе устроили торжественные похороны в Сухуме, на которые собралось свыше 30 тысяч человек. Архитектор В.А. Щуко и автор проекта дома отдыха ЦИК «Мюссера» В.Г. Гельфрейх прислали телеграмму со словами соболезнования в адрес ЦИК Абхазии.
В начале сентябре 1930 года И.В. Сталин приехал г. Сухуми на отдых с женой Н. Аллилуевой и дочерью