родился в 1964 году в Кутаиси. Окончил юридический факультет Тбилисского университета. В 1992–1997 гг. работал в Министерстве государственной безопасности, там он сначала возглавлял группу правового обеспечения отделения международных отношений и правового обеспечения аппарата министра, затем был начальник отдела правовых отношений департамента управления и контроля, помощник министра по юридическим вопросам, в 1998–2000 – в Совете безопасности Грузии.
С весны по осень 2001 года был парламентским секретарем президента Эдуарда Шеварднадзе. 21 ноября 2001 утвержден на посту министра госбезопасности. Женат, двое детей, в 2003 г. защитил диссертацию на тему: Суверенитет и Конституционное право.
На своем посту Валерий Хабурдзания начал активно налаживать связи как с западными (Хабурдзания часто бывал в Англии и США), так и с российскими коллегами, постоянно выезжал в Москву для встреч с Патрушевым. В отличие от своих предшественников Хабурдзания на самом деле пытался захватить Гочияева – главного обвиняемого во взрывах домов в Москве осенью 1999 года. Эта попытка сорвалась, но МГБ удалось поймать в июле 2002 года Адама Деккушева, а потом и Юсуфа Крымшамхалова – двух главных подельников Гочияева по версии российской Генпрокуратуры. Тогда говорили даже о совместной операции российских и грузинских спецслужб в Панкисском ущелье. Он добился выдачи от России Шоты Чичиашвили, которого в Грузии обвиняли в организации серии громких похищений.
На своей должности Хабурдзания ратовал за серьезные кадровые и структурные изменения. Сам он был привержен идее создания современной спецслужбы по немецкому образцу, которая бы защищала конституционный порядок. Хабурдзания требовал полной деполитизации ведомства и освобождения его от расследования экономических преступлений. Он отправил в отставку несколько своих заместителей и руководителя антитеррористического центра. Он же официально признался в наличии боевиков из Чечни и ближневосточных стран в Панкисском ущелье, что изначально отрицалось грузинскими властями.
При нем численность МГБ достигла около четырех тысяч человек с техническим персоналом. Бюджет системы госбезопасности был около 10 млн лари, а средняя зарплата офицера – сто лари.
Структура МГБ выглядела следующим образом:
• департамент контршпионажа;
• департамент контртерроризма;
• следственный департамент;
• департамент экономической контрразведки и борьбы с саботажем;
• департамент защиты конституционного строя;
• департамент военной контрразведки;
• административное управление;
• оперативный департамент;
• департамент по вопросам защиты гостайны;
• департамент секретности;
• департамент инспекции и собственной безопасности;
• департамент кадров;
• центр специальных операций;
• центр радиоконтрразведки;
• центр