войну 15 июня 1918 г. он был призван в РККА в Москве и зачислен красноармейцем в 6-й Московский советский пехотный полк. Затем с августа служил там же в караульной команде Сущевско-Марьинского военкомата, с мая 1919 г. – в 109-м Интернациональном полку. С августа 1919 г. Н. Т. Щербаков служил в войсках и органах ВЧК – ОГПУ – НКВД. Вначале был писарем в батальоне Московской ЧК (Кисельный пер., 12), с апреля 1920 г. – пом. заведующего оружием запасного батальона военизированной охраны ВЧК. С мая по август 1920 г. находился на учебе на оперативных курсах при ВЧК, затем работал сотрудником особого отдела ВЧК в 4-й армии РККА в Вильно. В этой должности участвовал в Советско-польской войне 1920 г. С сентября 1920 г. проходил службу во 2, 3 и 4-м пограничных особых отделениях Особого отдела ВЧК Западного фронта, и. д. начальника особого поста, коменданта и военного следователя. Участвовал в борьбе с вооруженными формированиями С. Н. Булак-Балаховича и Б. В. Савинкова, бандгрупп «Ката» Чигиря, Брановицких, Орлова и других в Белоруссии. После войны Н. Т. Щербаков проходил службу в пограничных отрядах ВЧК – ОГПУ – НКВД БССР. С марта 1924 г. был комендантом пограничного участка Тимниковицкого пограничного отряда войск ОГПУ (отряд No 31), с апреля – уполномоченным 8-го пограничного отряда ОГПУ БССР (округ 189), затем 11-го и 16-го погранотрядов (последний был переименован в 18-й погранотряд). С 10 сентября 1925 по 1 февраля 1927 г. учился в Высшей пограничной школе ОГПУ, по окончании проходил службу уполномоченным и старшим уполномоченным в 15, 12 и 13-м пограничных отрядах. С февраля 1932 г. и.д. инспектора отделения Управления пограничной и внутренней охраны НКВД Смоленской обл., с мая 1935 г. служил в той же должности в Калининской обл. С августа 1937 г. был начальником 1-го отделения оперативного отдела Управления пограничных войск НКВД Азербайджанского округа, с августа 1938 г. – начальником 42-го Джебраильского пограничного отряда войск НКВД (г. Баку). В 1939 г. избран делегатом на XVIII съезд ВКП(б) (с правом решающего голоса), а в 1940 г. – кандидатом в члены ЦК КП(б) Азербайджана. Указом Президиума Верховного Совета СССР от 15.2.1941 как начальник погранотряда и в ознаменование 20-й годовщины пограничных войск НКВД он был награжден орденом Красной Звезды. В начале Великой Отечественной войны полковник Н. Т. Щербаков был переведен в кадры РККА и назначен командиром 244-й стрелковой дивизии. С июля по сентябрь 1941 г. дивизия под его командованием в составе 31-й армии Резервного фронта, затем 30-й и 19-й армий Западного фронта участвовала в Смоленском сражении (вела бои западнее Ржева и северо-восточнее Ярцево) и в Вяземской оборонительной операции. С 5 октября 1941 г. командовал Гжатской группой (по обороне г. Гжатск и района). С 20 октября и. д. для поручений при Военном совете Западного фронта (по формированию выходящих из окружения бойцов и командиров). В феврале 1942 г. генерал-майор Н. Т. Щербаков был назначен командиром 4-й отдельной стрелковой бригады в составе 5-го гвардейского стрелкового корпуса 16-й армии Западного фронта, в этой должности участвовал в наступательных боях на жиздренском направлении. С апреля 1942 г. в той же армии вступил в командование 324-й стрелковой дивизией, которая
