Некоторые ложи преследовались по подозрению в роялизме. В то же время французские вольные каменщики явились авторами «Декларации прав человека и гражданина». Среди руководителей якобинцев значились имена «детей вдовы» Кутона, Марата, Дантона, Демулена, Шометта и др. В целом во время революции масонская деятельность почти полностью прекратилась, практически все ложи закрылись. Великая ложа не работала. Лишь Великий Восток подавал некоторые признаки существования.
Возрождение французского масонства началось после революции. В 1795 г. был реанимирован Великий Восток. С 1796 г. возобновилась работа других Послушаний. Во время I Империи произошло огосударствление масонства, сопровождавшееся приданием ему внешнего блеска. Наполеон, официально не признавая масонства, предпочел, тем не менее, поставить его под свой контроль. Великим Мастером Великого Востока был назначен Жозеф Наполеон, который не был вольным каменщиком и на заседаниях не появлялся. Заместителем Жозефа стал принц Луи Наполеон, позднее, в 1805 г., – Камбасерес; Великим администратором – маршал Массена; Первым Великим надзирателем – маршал Мюрат, который, будучи по своему роду деятельности в постоянных разъездах, не участвовал в масонских собраниях. Активно действовали в наполеоновской армии военные масонские ложи. Часть вольных каменщиков оказалась в рядах как роялистской, так и республиканской оппозиций. В период реставрации французское масонство возглавлял Людовик XVIII.
С 20-х гг. XIX в. организационные формы масонства пытались приспособить для своих нужд разного рода революционеры. Еще в начале века в Италии возникло движение карбонариев (угольщиков), ставившее своей целью освобождение страны от французского владычества, а позднее – проведение революционно-радикальных преобразований. Организация состояла из вент – законспирированных ячеек по 10–20 человек в каждой, была построена на принципах строгой иерархичности и жесткой дисциплины. Из Италии движение распространилось на Францию и некоторые другие страны. Руководители карбонариев коренным образом переработали и наполнили экстремистским содержанием масонские уставы и ритуалы. Между карбонариями и масонами во Франции, очевидно, сложился союз. Некоторые вольные каменщики на индивидуальной основе входили в карбонарские венты. В контакте с тайными обществами находилась и часть лож. И те и другие сыграли определенную роль в Июльской революции 1830 г. во Франции: карбонарии – в качестве организаторов и участников уличного восстания в Париже, либералы-масоны – как устроители новой власти.
В межреволюционный период Братство вольных каменщиков объединяло в своих рядах, как обычно, людей различных взглядов, философских и политических пристрастий. В него входили деятели умеренной, радикальной, революционной партий. В 40-х гг. XIX в. во французском обществе усилились республиканские настроения, что нашло свое отражение и в деятельности ордена. Его члены с энтузиазмом приняли революцию 1848 г. и установление республики. В воззвании Великого Востока Франции по случаю установления республики