рассматривается в составе судьи федерального суда и коллегии из 12 присяжных заседателей, то профессиональный судья руководит ходом следствия, проводимого в порядке ст. 335 УПК РФ (выслушивание заявлений государственного обвинителя и защитника, установление порядка исследования доказательств, формулировка вопросов допрашиваемым, исключение из уголовного дела доказательств как по собственной инициативе, так и по ходатайству сторон, разрешения в отсутствии присяжных заседателей вопроса о недопустимости доказательств). В соответствии со ст. 336 УПК РФ во время прений сторон судья должен следить за тем, чтобы содержание речей его участников находилось лишь в пределах вопросов, подлежащих разрешению присяжными заседателями, и чтобы при этом стороны не ссылались в обоснование своей позиции на доказательства, которые в установленном порядке признаны недопустимыми или не исследовались в судебном заседании. При отступлении от этого судья, согласно ч. 3 ст. 336 УПК РФ, «прерывает такие выступления и разъясняет присяжным заседателям, что они не должны учитывать данные обстоятельства при вынесении вердикта».
С учетом результатов судебного следствия и прений сторон судья формулирует в письменном виде вопросы, подлежащие разрешению присяжными заседателями, зачитывает их и передает сторонам. В отсутствие присяжных заседателей судья с участием сторон обсуждает формулировку вопросов и с учетом замечаний и предложений сторон в совещательной комнате окончательно формулирует вопросы, подлежащие разрешению присяжными заседателями, и вносит их в вопросный лист, который и подписывает (ст. 338 УПК РФ). Вопросный лист содержит в себе три основных вопроса: «1) доказано ли, что деяние имело место; 2) доказано ли, что это деяние совершил подсудимый; 3) виновен ли подсудимый в совершении этого деяния» (ч. 1 ст. 339 УПК РФ). Кроме этого, могут быть постановлены и частные вопросы об обстоятельствах, которые увеличивают или уменьшают степень виновности либо изменяют ее характер, влекут за собой освобождение подсудимого, а также другие из числа указанных в ч. 3 и 4 ст. 339 УПК РФ вопросы. Вопросы ставятся в понятных присяжным заседателям формулировках.
Огромное значение при рассмотрении дела судьей с участием присяжных заседателей (в суде присяжных) имеет напутственное слово председательствующего, с которым он обращается к присяжным заседателям перед удалением их в совещательную комнату для вынесения вердикта. В напутственном слове председательствующий: «1) приводит содержание обвинения; 2) сообщает содержание уголовного закона, предусматривающего ответственность за совершение деяния, в котором обвиняется подсудимый; 3) напоминает об исследованных в суде доказательствах, как уличающих подсудимого, так и оправдывающих его, не выражая при этом своего отношения к этим доказательствам и не делая выводы из них; 4) излагает позиции государственного обвинения и защиты; 5) разъясняет присяжным основные правила оценки доказательств в их совокупности; сущность принципа презумпции