Большинство соловецких ревнителей старообрядчества было истреблено.
Идеологи старообрядчества подверглись преследованиям и пыткам. Наиболее фанатичные противники реформы протопоп Аввакум, дьякон Федор, поп Лазарь и инок Епифаний были сосланы на север в Пустозерский острог, где были сожжены уже в царствование Федора Алексеевича за государственное преступление – «великия на царский дом хулы».
Но и патриарху Никону недолго пришлось торжествовать. Его стремление подчинить патриаршеству царскую власть являлось реакционным и несовместимым с русской государственной традицией. К 1658 г. наступило резкое охлаждение отношений патриарха с царем, прежде глубоко уважавшим Никона, возвысившим его и готовым к согласию с ним в вопросах церковных, но отвергавшим претензии на светскую власть. Воспользовавшись как формальным поводом оскорблением, нанесенным его приближенному, Никон демонстративно оставил патриаршью кафедру, рассчитывая, что царь ужаснется «вдовству Церкви» и станет умолять его вернуться на условиях своего подчинения патриарху. Но царь Алексей Михайлович проявил лишь сдержанную корректность, попросил Никона вернуться, а когда тот отказался, не стал настаивать. В 1664 г. Никон попытался вернуться на патриаршество, но ему было недвусмысленно заявлено от имени государя, что он по собственной воле незаконно оставил свое служение и теперь должен ожидать решения своего вопроса. В 1666 г. Собор восточных патриархов и российского духовенства рассмотрел дело Никона и лишил его патриаршего сана. Никон был сослан в Белозерско-Ферапонтов монастырь. В 1681 г. царь Федор Алексеевич амнистировал опального Никона и разрешил ему вернуться в построенный им под Москвой Новый Иерусалим, но по дороге бывший патриарх скончался. Созданный его действиями раскол принес неисчислимые бедствия сотням тысяч верующих соотечественников, и лишь в XX в. Русская православная церковь признала несправедливость наложенных на старообрядцев проклятий.
4.5. Царь Федор Алексеевич
Царь Алексей Михайлович умер 29 января 1676 г. Престол наследовал его старший сын Федор. Несмотря на слабое здоровье, новый царь получил хорошую подготовку, был высокообразованным человеком с широкими взглядами. Он знал латинский и польский языки, сам сочинял музыку, при его участии создавалась Славяно-греко-латинская академия. В правление Федора Алексеевича была проведена всеобщая перепись населения. В 1679–1681 гг. по итогам этой переписи было введено подворное налогообложение. Федор преобразовал систему судопроизводства, передав уголовные дела на местах в ведение воевод. В 1682 г., незадолго до смерти он осуществил важнейшую реформу своего царствования – отменил местничество – изжившую себя систему занятия государственных и военных должностей не по заслугам, а по происхождению. Разрядные книги, служившие основанием для претензий и постоянных конфликтов между военачальниками и чиновниками, были торжественно сожжены.