Великой Турецкой войны стали и походы Василия Голицына.
В 1689 году начались приготовления ко второму походу. Речь Посполитая начала переговоры с Османской империей, перекладывая всё бремя войны на Россию.
Стоит сказать вот о чем – бояре и дворяне были очень недовольны неудачей первого Крымского похода:
«Во время подготовки ко второму походу в воротах дома Голицына был обнаружен гроб с запиской, в которой боярину пообещали, что он будет убит, если не вернётся на этот раз с победой. Ещё раньше к саням „оберегателя“ бросился убийца, но был схвачен охраной и тайно казнён в одном из московских застенков».
С марта по май май произошел второй поход русской армии Василия Васильевича Голицына на Крым
Ранней весной или даже в феврале 1689 года русское войско, увеличенное до 150 тысяч человек (по другим данным – 112 тысяч при 400 орудиях) направилось на юг.
15 мая недалеко от деревни Зелёная Долина произошло нападение крымских татар, которое было отбито артиллерийским огнём и ружейными залпами.
Карло Боссоли. Вид Крыма, показывающий окрестности Перекопа
20 мая русская армия подошла к Перекопу. Однако, возглавлявший поход Василий Голицын отказался брать Перекоп, так как в нём было всего три колодца с пресной водой, чего не хватило бы для армии. Кроме того, за Перекопом простиралась безводная степь, и потери после взятия Перекопа были бы весьма значительны. На военном совете было решено строить несколько крепостей для накопления в них воды, продовольствия и снаряжения. Русские отказались от генерального сражения и отступили от Перекопа, но сохранили почти всю армию (по официальной истории).
В итоге, Крымские походы имели большое международное значение, смогли на время отвлечь значительные силы турок и крымских татар и весьма способствовали военным успехам европейских союзников России в борьбе против Османской империи, прекращению турецкой экспансии в Европе, а также распаду заключённого в 1683 году в Адрианополе союза между Крымским ханством, Францией и перешедшим в турецкое подданство Имре Тёкёли. Вступление России в Священную Лигу спутало планы турецкого командования, вынудив его отказаться от наступления на Польшу и Венгрию и перебросить значительные силы на восток, что облегчило борьбу Лиги против турок. Однако, несмотря на значительное превосходство в силе, поход огромной армии закончился её исходом, сколь-нибудь значимого столкновения между противоборствующими сторонами не произошло, а Крымскому ханству не было нанесено поражение. Вследствие этого действия русской армии подверглись критике со стороны историков и некоторых современников.
Провал похода стал одной из причин падения Софьи в Москве, Петр стал полноправным самодержцем, взявшим курс на модернизацию России по западному образцу. Селим стал пользоваться еще большим авторитетом