следующей главе мы рассмотрим основные инструменты и методы биоинформатики, используемые в геномике. Мы узнаем, как биоинформатика помогает нам анализировать геномные данные она используется практике.
Глава 2. Методы секвенирования и геномных данных
2.1. Технологии секвенирования нового поколения
В предыдущей главе мы рассмотрели основы геномики и важность секвенирования ДНК в понимании функций генов их роли организме. Теперь перейдем к обсуждению технологий нового поколения, которые революционизировали область позволили исследователям анализировать геномы с беспрецедентной скоростью точностью.
История секвенирования ДНК
Первые технологии секвенирования ДНК были разработаны в 1970-х годах и основывались на методе Максама-Гилберта Сэнгера. Эти методы позволяли секвенировать короткие фрагменты ДНК, но достаточно медленными трудоемкими. В 1990-х была разработана технология основе капиллярного электрофореза, которая позволяла более длинные с большей скоростью. Однако, эти все еще дорогими требовали значительных ресурсов.
Технологии секвенирования нового поколения
В 2005 году была разработана первая технология секвенирования нового поколения – 454-пиро-секвенирование. Эта позволяла секвенировать короткие фрагменты ДНК с высокой скоростью и точностью. 2007 Solexa (теперь Illumina), которая более длинные еще большей
Сегодня существует несколько технологий секвенирования нового поколения, включая:
Illumina: одна из наиболее популярных технологий секвенирования, которая позволяет секвенировать более 100 Гб данных за один запуск.
Life Technologies: технология, которая позволяет секвенировать более 10 Гб данных за один запуск.
PacBio: технология, которая позволяет секвенировать более длинные фрагменты ДНК с высокой точностью.
Oxford Nanopore: технология, которая позволяет секвенировать ДНК в режиме реального времени с помощью нанопор.
Преимущества технологий секвенирования нового поколения
Технологии секвенирования нового поколения имеют несколько преимуществ перед традиционными технологиями секвенирования:
Высокая скорость: технологии секвенирования нового поколения позволяют секвенировать геномы с беспрецедентной скоростью, что позволяет исследователям анализировать большое количество данных за короткое время.
Высокая точность: технологии секвенирования нового поколения позволяют секвенировать ДНК с высокой точностью, что позволяет исследователям обнаруживать даже небольшие изменения в геноме.
Низкая стоимость: технологии секвенирования нового поколения значительно снижают стоимость ДНК, что делает его более доступным для исследователей и клинических приложений.
Применение технологий секвенирования нового поколения
Технологии секвенирования нового поколения имеют широкое применение в различных областях, включая:
Геномика: