Биоинформатика в геномике: теория и практика. Биотехнолог

последовательности

      Геномные последовательности представляют собой линейные нуклеотидов (А, С, Г и Т), которые составляют геном живого организма. Эти могут быть получены с помощью методов секвенирования ДНК, таких как Сanger-секвенирование или новое поколение (NGS). являются основой для всех биоинформатических анализов, поскольку они содержат информацию о структуре функции генома.

      2.2.2. Экспрессионные данные

      Экспрессионные данные представляют собой информацию о уровне экспрессии генов в различных условиях. Эти могут быть получены с помощью методов микрочипов, секвенирования РНК (RNA-seq) или других технологий. позволяют исследователям понять, как гены регулируются ответ на различные факторы, такие окружающая среда, заболевания лечение.

      2.2.3. Структурные данные

      Структурные данные представляют собой информацию о трехмерной структуре белков и других биологических макромолекул. Эти могут быть получены с помощью методов рентгеновской кристаллографии, ядерной магнитной резонансной спектроскопии (ЯМР) или технологий. позволяют исследователям понять, как белки другие биологические макромолекулы взаимодействуют другими молекулами выполняют свои функции.

      2.2.4. Функциональные данные

      Функциональные данные представляют собой информацию о функциях генов и белков. Эти могут быть получены с помощью методов биоинформатики, таких как предсказание функций или белков на основе их последовательностей структур. позволяют исследователям понять, гены белки участвуют в различных биологических процессах они регулируются.

      2.2.5. Интегративные данные

      Интегративные данные представляют собой информацию, которая объединяет из различных источников, таких как геномные последовательности, экспрессионные данные, структурные и функциональные данные. Эти позволяют исследователям понять, различные биологические процессы взаимодействуют они регулируются.