Федерация не будет считать себя связанной обязательствами, предусмотренными ст. 1 Протокола, в случае нападения на Российскую Федерацию, Вооруженные Силы РФ или другие войска, на ее союзников или на государство, с которым она связана обязательствами в отношении безопасности, осуществляемого или поддерживаемого государством, не обладающим ядерным оружием, совместно с государством, обладающим ядерным оружием, или при наличии союзнических обязательств перед этим государством.
Российская Федерация делает заявления о снятия оговорок. 6 декабря 2000 г. Федеральным законом № 143-ФЗ были сняты сделанные СССР оговорки к Протоколу о запрещении применения на войне удушливых, ядовитых или других подобных газов и бактериологических средств от 17 июня 1925 г. 3 октября 2008 г. Российская Федерация ратифицировала Соглашение о сотрудничестве государств – участников СНГ в борьбе с преступлениями в сфере компьютерной информации со следующей оговоркой: «Российская Федерация оставляет за собой право отказать в исполнении запроса полностью или частично, если исполнение запроса может нанести ущерб ее суверенитету или безопасности». 21 февраля 2007 г. принят Федеральный закон от 3 марта 2007 г. № 28-ФЗ «О снятии оговорок к некоторым международным договорам». Российская Федерация сняла оговорки в отношении шести конвенций, подписанных и ратифицированных СССР: 1) Конвенции о борьбе с незаконным захватом воздушных судов; 2) Конвенции о борьбе с незаконными актами, направленными против безопасности гражданской авиации; 3) Конвенции о предотвращении и наказании преступлений против лиц, пользующихся международной защитой, в том числе дипломатических агентов; 4) Конвенции о защите ядерного материала; 5) Международной конвенции о борьбе с захватом заложников; 6) Конвенции о преступлениях и некоторых других актах, совершаемых на борту воздушных судов. Снятием этих оговорок Российская Федерация взяла обязательство, что любой спор между двумя и более государствами-участниками может быть передан в арбитраж или в Международный суд ООН.
Помимо оговорок государства вправе делать заявление, или, иначе, мнение в связи с подписанием договора. Эта акция не меняет содержание договора и его юридические последствия. Российская Федерация к Европейской конвенции о выдаче сделала пять заявлений, а также заявление к Дополнительному протоколу, а к Европейской конвенции о взаимной правовой помощи по уголовным делам даны два заявления. В Европейской конвенции о выдаче в ст. 3 говорится о политических преступлениях. Российская Федерация в Федеральном законе о ратификации данной Конвенции сделала заявление, что законодательство Российской Федерации не содержит понятия «политическое преступление». 11 июля 2007 г. Российская Федерация ратифицировала Конвенцию о передаче осужденных лиц и Дополнительного протокола в ней. При ратификации Конвенции Российская Федерация заявила, что «она должна уведомляться о перевозке осужденного лица воздушным путем над территорией Российской Федерации».
Практика оговорок и заявлений стала настолько многочисленной,