18 апреля 1963 года ЦК КПСС и Совет министров СССР приняли постановление о перестройке работы ВДНХ СССР. Ключевым моментом этого постановления был пункт первый:
«1. <…> показ достижений союзных республик в развитии промышленности, строительства и сельского хозяйства осуществлять в отраслевых павильонах Выставки <…>, а показ общих достижений республик <…> сосредоточить в Центральном павильоне выставки, упразднив в связи с этим павильоны союзных республик».
В новом своем виде выставка организовывалась по отраслевому принципу. Часть павильонов, посвященных различным отраслям промышленности, сохраняют свой статус, а павильоны союзных республик перепрофилируются и начинают представлять различные области народного хозяйства СССР. Следует с грустью отметить, что именно это нанесло огромный ущерб целостности архитектурного ансамбля ВСХВ. Многие павильоны получили современные фасады или были вовсе снесены. Но еще в 1955 году по решению Никиты Сергеевича Хрущева началась борьба с «излишествами» в строительстве, которая нашла свое отражение и в оформлении выставки. Наступило время минимализма в архитектуре. Многие павильоны лишились своего богатого убранства, пышные сооружения с колоннами и скульптурой уступили место серым коробкам. Новое время – новая мода, да и вера в прекрасное коммунистическое завтра постепенно начинает исчезать.
После перехода на отраслевой принцип показа достижений с республиканских павильонов были сняты уникальные декоративные элементы. На площади Колхозов подверглись реконструкции фасады и интерьеры бывших павильонов «Казахская ССР», «Армянская ССР», «Азербайджанская ССР».
Павильон «Поволжье» ВСХВ-39 и ВСХВ-54, представлявший собой стальной мост над бурным каскадом вод «Большой Волги», получил серый железобетонный фасад и новое назначение – «Радиоэлектроника и связь».
Разрушили гармоничный павильон «Грузинская ССР», а павильон «Дальний Восток» был в 1959 году переименован в «Советскую книгу».
Невосполнима утрата ансамбля центральной аллеи, где были снесены не просто павильоны, а республиканские и краевые павильоны – «Таджикская ССР», «Туркменская ССР», «Татарская АССР», «Башкирская АССР», «Киргизская ССР» и «Центральные области». А именно среди этих павильонов в 1941 году на ВСХВ встретились герои фильма «Свинарка и пастух». На площади Механизации исчезли павильоны «Совхозы» (позже «Транспорт») и «Зерно» («Легкая промышленность»), появились два новых стеклянных павильона «Химическая промышленность» (№ 20) и длинный павильон № 57.
В 1967 году архитектор Л. И. Браславский полностью перестроил павильон «Животноводство», возведенный в 1939 году по проекту П. Ревякина. Здесь разместилась «Электрификация». В 1960—1970-х годах появились еще несколько новых павильонов: «Вычислительная техника», «Рыбное хозяйство» и многие другие.
Сложное время очередей и постоянного дефицита продуктов питания и товаров народного потребления 1970– 1980-х годов не лучшим образом повлияло