Персонализированная медицина нового поколения: клональная реконституция гемопоэза и CHIP-основанная
гемопоэза у человека, проявляющихся в виде дополнительных соматических мутаций ДНК хроматина клеток человека. Именно поэтому при секвенировании генома мы получаем клональный гемопоэз с неопределенным потенциалом. На уровне транскриптома клональный гемопоэз начинает демонстрировать основные черты будущей трансформации СК и проявляется определенным набором нарушений экспрессии РНК, продуцируемых мутантными генами клональности. Поэтому на транкриптомном уровне исследования РНК стволовых клеток можно убедительно увидеть формирование генетических полиморфизмов рака, сердечно-сосудистых нарушений и других молекулярно-биологических изменений. Неопределенность начинает отступать уже на этом уровне, и в большинстве случаев по транскриптомному профилю РНК можно уже диагностировать ряд тяжелых гематоонкологических болезней и различные формы рака. Поэтому картирование и профилирование экспрессии РНК позволяет в ряде случаев диагностировать сложные болезни цивилизации, которые на генетическом уровне выявить не удается. На уровне протеома уже формируется молекулярная специфичность белков патологии кроветворной стволовой клетки и выявляется патоспецифичность и нозоспецифичность клонального гемопоэза. На протеомном уровне исчезает неопределенность в диагностике нарушений кроветворения и гемопоэз приобретает черты определенной специфичности: онкоспецифичности, нейроспецифичности, кардиоспецифичности, аутоиммунной специфичности и т. д.
Идентифицированные к настоящему времени клоны CHIP демонстрируют ряд крупномасштабных mCA, включая делеции, дупликации и копировально-нейтральную потерю гетерозиготности (CN-LOH) на всех хромосомах (Jacobs K. B., Yeager M., Zhou W. et al., 2012; Laurie C. C., Laurie C. A., Rice K. et al., 2012; Machiela M. J., Zhou W., Sampson J. N. et al., 2015; Loh P-R, Genovese G., Handsaker R. E. et al.,2016). КГ, вызванный mCA, в первую очередь предрасполагает к лимфоидным злокачественным новообразованиям, таким как хронический лимфоцитарный лейкоз (ХЛЛ), и связан с двукратным увеличением смертности от всех причин (Loh P.-R., Genovese G., Handsaker R. E. et al., 2016; Loh P.-R., Genovese G., McCarroll S. A., 2020). В частности, было продемонстрировано, что события, связанные с CN-LOH с мутацией JAK2, значительно повышают сердечно-сосудистый риск (Loh P.-R., Genovese G, McCarroll S. A., 2020). Кроме того, mCA-ассоциированный CH может привести к нарушению иммунной функции, что делает людей более восприимчивыми к инфекциям (Zekavat S. M., Lin S-H, Bick A. G. et al., 2020).
Опять же, важно отметить, что термин CHIP следует применять только к людям с нормальными показателями крови (Valent P., Kern W., Hoermann G. et al., 2019). В случаях, когда CHIP идентифицируется наряду с одной или несколькими персистирующими цитопениями, которые иначе не объясняются гематологическими или негематологическими состояниями и которые не соответствуют диагностическим критериям определенных миелоидных новообразований (МН), состояние называют CCUS (клональная цитопения неопределенного происхождения) (Khoury J. D., Solary E., Abla O. et al., 2022). И CCUS, и CHIP становятся более распространенными с возрастом и относительно распространены среди пожилых людей (Arber D. A., Orazi A., Hasserjian R. P. et al., 2022). Пациенты с CHIP имеют повышенный риск развития ЗНO по сравнению с контрольной группой без CHIP (Busque L., Patel J. P., Figueroa M. E. et al., 2012; Malcovati L., Cazzola M., 2015; Sperling A. S., Gibson C. J., Ebert B. L., 2017), а также имеют повышенный